LOD skore

Dobry den,
Chtela bych se zeptat, jaky musi byt pomer rekombinantu a non-rekombinantu, aby mi ve vyslednem pomeru vyslo LOD skore zaporne. V teoretickych uvahach mi vychazi vzdy minimalne nula, ktera vylucuje vazbu... jak se tedy vysledky LOD skore hodnoti? Pokud vyjde 3, znamena to 1000 x vetsi pravdepodobnost pro pritomnost vazby... Pokud vyjde 2, znamena to pravdepodobnost 100x vetsi pro vazbu... ? A jak tedy vyhodnotim zaporne hodnoty? Pokud bude napr. -3, znamena to ze bude pravdepodobnost 1000:1, ze tam vazba neni? Dekuji K.

Sdílejte tuto stránku

RE: LOD skore

Dobrý den,

je to jak píšete: výsledek 3 znamená, že je přítomnost vazby 1000x pravděpodobnější, než její nepřítomnost; naopak v případě záporného výsledku (-3) by byla přítomnost vazby 1000x méně pravděpodobná, nežli její nepřítomnost. Pro potvrzení vazby většinou požadujeme skóre alespoň 3, pro vyloučení pak alespoň -2 (více například zde http://biol.lf1.cuni.cz/ucebnice/geneticka_kartografie.htm#lod)

Přeji hezký den.